آیه الله جوادی آملی، از توانایی بحث و قدرت استدلالی او می گوید:
علامه خاطر نشان کرده اند:
سالی تابستان را در درکه اطراف تهران به سر می بردم. در آن سال ها افکار کمونیستی و ماتریالیستی رایج بود، یکی از صاحبنظران افکار مادی میل پیدا کردند با ایشان به بحث آزاد بنشیند. به حضور ایشان رفت، در همان ییلاقی که در تابستان می گذراندند. علامه می فرمودند:
"وقتی که این صاحب نظر آمد از صبح شروع کرد تا پایان روز بحث به درازا کشید و شاید قریب هشت ساعت ادامه پیدا کرد و من از راه برهان صدیقین با این فرد به سخن نشستم."
"بعدا این صاحب نظر مادیگرا در یکی از خیابان های تهران یکی از همفکران خود را دید و آن همفکرش از او پرسید: تو در دیدار و در مناظره و گفت و گو با آقای طباطبایی به کجا رسیدی؟ گفت: آقای طباطبایی مرا موحد کرد!"
نظری، مرتضی. آن مرد آسمانی: خاطره های از زندگی فیلسوف بزرگ شرق، آیت الله سید محمدحسین طباطبایی. تهران: دفتر نشر فرهنگ اسلامی، 1382. ص. 116